May 2008


Ahir, a l’hotel “Rey Don Jaime” de Castelldefels  es va celebrar el “GRIB RETREAT’08″, una trobada dels diferents grups de recerca del GRIB (Grup de Recerca en Informàtica Biomèdica). La trobada va començar amb una introducció, per part dels responsables de cada grup, de la recerca que es mostrava a la trobada. Seguidament, la primera sessió de pòsters. Després dinar, segona sessió de pòsters i, finalment, resum i conclusions.

Va ser una bona oportunitat per estar al dia del que fa la gent dels altres grups, veure que no només es comparteix el fet de treballar amb ordinadors, estudiar possibles col·laboracions,… i, per que no, fer una mica de vida social, que no tot és feina! Jo, personalment (de moment només sóc “col·laborador” -a través del meu coodirector de tesi-, al setembre hi començo el postdoc) em vaig sorprendre de la intensa activitat científica que es cou en el passadís del PRBB on som, molta informació, bones idees, interessants mètodes,…

Durant les conclusions, els diferents representants de cada grup,  van insistir en la necessitat de repetir aquest tipus de trobades. Espero que sigui veritat ja que sempre està bé saber què es cou més enllà del teu despatx.

Fa una estona s’ha conegut que el premi Príncep d’Astúries en Cooperació Internacional d’enguany ha anat a parar a les organitzacions que lluiten contra la malària a l’Àfrica. Les organitzacions premiades són la Ifakara Health Research and Development Centre (Tanzània), el Malaria Research and Training Centre (Mali), el Kintampo Health Research Centre (Ghana) i el Centre d’investigació en salut de Manhiça (Moçambic). En aquest darrer centre hi col·labora el grup d’investigació català liderat pel científic Pedro Alonso.

Consideracions personals borbòniques a banda, m’alegro de la resolució del premi d’enguany. La malària és una de les malalties oblidades (tot i que com que afecta als turistes del nord no és de les més oblidades) que causen estralls als països que estan en vies de desenvolupament i, tot i que la dotació econòmica del premi (50.000 euros) no és una gran quantitat en el món de la recerca, premiar la recerca i la lluita contra les malalties oblidades, és un bon estímul per continuar-hi treballant. Felicitats!

Ahir al vespre, a la Facultat de Medicina de la Universitat de Barcelona va tenir lloc la taula rodona L’accés als medicaments com a dret humà: situació actual i iniciatives, de la campanya Salut per al Desenvolupament i emmarcada en el cicle Fàrmacs en un món global, organitzat per Justícia i pau.

L’acte, presentat i moderat per la periodista i membre del consell assessor de la campanya va comptar amb les intervencions de Xavier Seuba, professor Dret internacional Públic i Relacions Internacionals de la Universitat Pompeu Fabra, que ens va parlar dels medicaments com a dret humà fent un repàs històric amb alguns exemples. A continuació, el periodista del El País, Emilio de Benito, especialitzat en temes de salut, ens va fer un repàs històric de l’accés als medicaments. Després va ser el torn de Graciela Diap, coordinadora mèdica de Drugs for Neglected Diseases initiative (DNDi), que va parlar de la iniciativa. I, finalment, un cas pràctic i en primera persona, Erlin Rugama, de l’organització Acción Médica Cristiana, de Nicaragua, que ens va parlar de la situació d’accés als medicaments a Nicaragua i de com les ventes socials de medicaments pretenen donar accés a la població que ho necessita.

L’acte es va cloure amb un torn de preguntes-debat entre els ponents i el públic assistent. Va ser una bona oportunitat per saber el que hi ha i, sobretot, saber què s’està fent i quines opcions hi ha per millorar l’accés als medicaments.

Treballo poc amb Windows, molt poc, el mínim i quan, realment, no hi ha més remei. Això sí, mai deixa de sorpendre’m, sobretot pels missatges que dóna quan hi ha errades. Avui, he intentat obrir un eps (imatge post cript) amb un ordinador amb windows, en comptes de l’esperat Gimp, s’ha intentat obrir el “FotoXof” i… el missatge ha estat curiós:

fotoxop.png

I… Linux és difícil?

Veig que també ho comenta en Xavier Caballé, avui l’aigua de Barcelona (com a mínim a la zona de Sant Antoni) fa força pudor (i gust!) de clor. Serà per anar-nos acostumant al mal gust (per mi pitjor que la de Barcelona, que ja és dir!) de l’aigua que vindrà de Tarragona?

Fa un parell de dies parlava d’una opció que tenim per “silenciar” part d’un residu en una dinàmica. El que comentava era que, ajustàvem la càrrega d’aquella part a zero i llestos. Per fer això, cada programa té les seves maneres.

Continua llegint: “Silenciar” part d’un residu en una dinàmica (II)

Plou com feia temps que no passava! és, certament, una molt bona notícia. Això no posa, de cap de les manera, fi al període de sequera, però és una bona notícia. Lamentablement, però, i lligat al país que ens té colonitzats, quan plou així, hi ha problemes: els trens (ecspanols) no funcionen (de fet, tampoc cal que plogui per que no funcionin), problemes de trànsit, arbres que cauen, i.. un de nou que pateixo els darrers anys: quan plou, em quedo sense connexió amb les màquines (ordinadors) de la feina, ja sigui per que hi ha algun problema amb la xarxa o bé per que cau el sistema elèctric de la sala de màquines (gran arquitecte el que el va dissenyar!).

En fi, per sort, de moment, encara hi ha electricitat (tot i els mini-talls) i connexió a internet…

Dies enrere, en Pere, un company de feina, va anar a una reunió que la URV havia convocat pels seus becaris de tercer any amb beca de la Generalitat. Els van explicar tot de coses sobre la tesi, quan s’acaba, dipòsit,… però em vaig quedar amb una, i destacable. Les tesis dels doctorands que han gaudit d’una beca de la Generalitat han d’alliberar la tesi amb llicència Creative Commons. No em va saber explicar amb detall quina variant de la llicència estan obligats a emprar per la tesi però el fet en sí ja és un avenç.

Continua llegint: Tesis amb llicència Creative Commons

Qui ho havia de dir, feia ja molt temps que no sentia quelcom similar: “suspès per metereologia adversa”. Que se suspengui un acte per motius metereològics és, actualment, una bona excepcionalitat. Doncs bé, avui he rebut dos correus anunciant que determinats actes que s’havien de fer al carrer s’han suspès per la pluja.

No és que m’afectin ja que són notícies que m’han arribat través de dues llistes de distribució i, a més a més, darrerament sóc monotemàtic (tesi), però m’ha fet gràcia veure que, avui en dia, encara es poden suspendre actes… per la pluja! (entenc però, la ràbia  que pot fer als organitzadors).

Fins fa una estona, tenia un problema: estic fent unes dinàmiques moleculars d’un enzim que catal·litza una reacció determinada, en aquest cas, l’oxidació de l’anió formiat a diòxid de carboni. La reacció transfereix un protó a l’enzim que, després s’ha de regenerar per recomençar el cicle. Fer la dinàmica d’aquesta reacció és relativament senzill, he afegit el substrat (formiat) al PDB de la proteïna i he fet la dinàmica. Perfecte, obtinc el CO2 i l’enzim protonat. Fer les dinàmiques de la regeneració de l’enzim ja no és tant fàcil: vull eliminar producte (el diòxid de carboni) però part del residu introduït al PDB (l’anió formiat) no vull que desapareixi, ja que és el protó que he d’estudiar com deixa l’enzim.

Continua llegint: “Silenciar” part d’un residu en una dinàmica

Next Page »